Палеогенетики секвенировали и проанализировали ДНК 28 африканцев, самый древний из которых умер около 10,2 тысячи лет назад. Исследователи обнаружили, что все южные африканцы, жившие больше 1,4 тысячи лет назад и попавшие в выборку, принадлежали к выделившейся как минимум 200 тысяч лет назад популяции, генетически отличавшейся от всех современных. Вместе с тем к этой южноафриканской популяции примерно на 79 процентов восходят представители современных койсанских народов, в геномах которых наблюдалась минимальная примесь из других частей Африки или Евразии. Об этом ученые пишут в статье, опубликованной в журнале Nature.
К настоящему времени палеогенетики уже успели секвенировать тысячи геномов древних людей. Однако большая часть образцов, в которых сохранилась ДНК, происходила из регионов с умеренным или холодным климатом. До сих пор в базах данных крайне мало древних геномов из Африки, поэтому популяционная история этого континента в основном известна только по последовательностям ДНК современным людей. Тем не менее за последние годы ученые сумели прочитать геномы нескольких людей каменного века из Северной Африки, самые древние из которых жили около 15–14 тысяч лет назад, а также с самого юга континента, в том числе из останков человека, умершего примерно 10 тысяч лет назад.
На этот раз Маттиас Якобссон (Mattias Jakobsson) из Уппсальского университета и его коллеги из научных организаций Норвегии, Швеции и ЮАР сообщили, что они секвенировали ДНК 28 человек эпохи голоцена, останки которых нашли в Южной Африке, к югу от реки Лимпопо. Для большинства образцов исследователи также получили радиоуглеродные датировки. Самый древний индивид из этой выборки жил на самом юге Африки приблизительно 10,2 тысячи лет назад, а самый поздний — всего 150 лет назад.
По данным исследователей, 25 из 28 индивидов из Южной Африки были носителями митохондриальной гаплогруппы L0d, линии которой сегодня распространены среди носителей койсанских языков. У древнейшего человека из выборки, а также еще у четырех мужчин ученые определили Y-хромосомную гаплогруппу A1b1b2a, которая тоже часто встречается у представителей койсанских народов. Ни у одного из исследованных людей палеогенетики не обнаружили аллели rs2814778, обеспечивающего защиту от малярии, а также аллели rs73885319, связанной с защитой от сонной болезни.
Палеогенетики определили, что все индивиды из выборки, жившие около 10,2–1,4 тысячи лет назад, принадлежали к одной популяции без какой-либо примеси. Причем при анализе главных компонент эти геномы оказались на самом краю распределения, образуя отдельный кластер от представителей всех современных популяций. По данным ученых, популяция этих древних южных африканцев отделилась от остальных между 310 и 240 тысячами лет назад. Эта оценка в целом соответствует результатам, полученным в ходе прошлых исследований и указывающим на то, что предки некоторых современных народов Южной Африки отделились от всего остального человечества очень рано (подробнее читайте тут и тут).
Судя по генетическим данным, популяция древних южных африканцев в течение очень долгого времени имела большой эффективный размер. Так, по данным авторов статьи, примерно 200 тысяч лет назад она составляла около 30 тысяч человек, но около 100–50 тысяч лет назад начала снижаться, достигнув отметки примерно в 10 тысяч индивидов во времена максимума последнего оледенения — приблизительно 20 тысяч лет назад. В гораздо более поздние эпохи представители популяции древних южных африканцев смешались с выходцами из других регионов. Больше всего наследия они оставили в генофонде койсанских народов. Так, ученые проанализировали 25 геномов современных носителей койсанских языков, у которых они наблюдали минимальный уровень примеси, и обнаружили, что примерно на 79 процентов их популяции восходят к древним южным африканцам.
Среди людей, с кем смешались потомки древних южных африканцев, были носители языков банту, которые в результате серии миграций, начавшейся около шести — четырех тысяч лет назад, широко расселились по континенту из Западной и Центральной Африки. При этом на новых землях выходцы из этих регионов активно смешивались с автохтонным населением, что подтвердилось и при масштабном анализе генетических данных.
